Erzurum İbrahim Hakkı Fen Lisesi, 1989 yılında ilk öğrencilerini alarak eğitime başlayan okul Meslek Lisesi'ne ait Erzurum Kongresi'nin yapıldığı tarihi binada Kasım 1997'ye kadar faaliyet gösterdikten sonra Yenişehir semtindeki yeni binasına taşınmış ve halen burada eğitime devam etmektedir.

Okul 2000'li yıllara kadar Türkiye'nin en başarılı 25 okul arasında yer almakta iken başarısı giderek düşmüştür. Eğitim kadrosu kurulduğu zamana göre zayıflamıştır. Bu durumda bile başarılı sayılabilecek konumda olup Ösym 2006 verilerine göre ülke genelinde en başarılı ilk 100 okul arasında yer almaktadır.